调节微生物区系，改善土壤微生态系统。腐熟的有机肥中含有酵母菌、乳酸菌、纤维素分解菌等有益微生物，而加有功能菌的生物有机肥还含有固氮菌、硅酸盐细菌、溶磷菌、光合细菌和假单胞菌等一些有益菌，这些微生物除了具有产生大量活性物质的能力外，还具有固氮、溶磷、解钾的能力，有的还具有抑制植物根系病原菌的能力，有的具有改善土壤微生态环境的能力。此外，生物有机肥施入土壤后，能够调节土壤中微生物的区系组成，使土壤
生物菌肥
调节微生物区系，改善土壤微生态系统。腐熟的有机肥中含有酵母菌、乳酸菌、纤维素分解菌等有益微生物，而加有功能菌的生物有机肥还含有固氮菌、硅酸盐细菌、溶磷菌、光合细菌和假单胞菌等一些有益菌，这些微生物除了具有产生大量活性物质的能力外，还具有固氮、溶磷、解钾的能力，有的还具有抑制植物根系病原菌的能力，有的具有改善土壤微生态环境的能力。此外，生物有机肥施入土壤后，能够调节土壤中微生物的区系组成，使土壤中的微生态系统结构发生有益改变。
在农业的部获得登记的生物有机肥生产企业，基本上以从事微生物肥料生产为主，在发酵生产工艺上，多采用槽式堆置发酵法，还有其他的发酵方法，如：平地堆置发酵法、发酵槽发酵法、密封仓式发酵法等在生产中也得到了应用。在发酵腐熟过程中物料的水分、碳氮比、温度等的调节及腐熟剂的使用是生产工艺的关键，特别是菌剂的应用直接影响着物料发酵的周期及腐熟程度。经过腐熟的物料基本实现了产品的无害化，从而也有利于后处理过程中所加入功能菌的存活。
生物有机肥设备所产产品是以鲜鸡、猪粪为原料，不含任何化学成份，而鸡、猪消化能力差，只能消耗掉25%的营养成份，而饲料中另外75%营养成分随粪便排出，从而使干成品含氮、磷、钾、有机质、氨基酸、蛋白质等成份。对堆肥产生的恶臭需加以防治与控制，避免二次污染。在堆料中加入发酵剂或分解菌可在较短时间内消减臭气，且感官效果较好;或者对堆肥场产生的恶臭气体以生物除臭技术等进行处理。
具下列任何一条款者，均为合格产品
a. 产品全部技术指标都符合标准要求； b. 在产品的外观、pH值、水分检测项目中，有1项不符合标准要求，而产品其它各项指标符合标准要求。
具下列任何一条款者，均为不合格产品
a. 产品中有效活菌数不符合标准要求；
b.有机质含量不符合标准要求；
c. 粪大肠菌群数不符合标准要求；
d. 蛔虫卵死率不符合标准要求；
e. As、Cd、Pb、Cr、Hg中任一含量不符合标准要求；
f.产品的外观、pH值、水分检测项目中，有2项以上不符合标准要求。
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